Artigo OriginalMachine Learning2024
Predição de Afinidade de Ligação Proteína-Ligante com Redes Neurais de Grafos Heterogêneos
Okonkwo, F.; Watanabe, K.; Cavalcante, R.
Chem & Computing vol. 8, n. 2, p. 112–131
GNNDockingDeep LearningPDB
Acervo Científico
Publicações
Artigos originais, revisões sistemáticas e comunicações em química computacional, modelagem molecular e quimioinformática.
Área
Ano
Revisão SistemáticaDFT2024
Funcionais de Troca-Correlação Híbridos para Modelagem de Reações Enzimáticas: Uma Revisão Crítica
Santos, G.; Müller, D.; Rodrigues, C.
Chem & Computing vol. 8, n. 1, p. 1–48
DFTQM/MMEnzimasB3LYP
Artigo OriginalDrug Design2024
Design Computacional de Inibidores Covalentes Seletivos da KRAS G12C por Docking Covalente e FEP
Cavalcante, R.; Okonkwo, F.
Chem & Computing vol. 8, n. 3, p. 198–221
KRASDocking CovalenteFEPOncologia
ComunicaçãoDin. Molecular2024
Transições Conformacionais de IDPs Mediadas por Fosforilação: Insights de Simulações CALVADOS 2
Watanabe, K.; Müller, D.
Chem & Computing vol. 8, n. 2, p. 145–158
IDPFosforilaçãoCALVADOSGROMACS
Artigo OriginalQSAR2023
Modelos QSAR Interpretáveis para Predição de Hepatotoxicidade com SHAP e Fingerprints Morgan
Rodrigues, C.; Cavalcante, R.; Okonkwo, F.
Chem & Computing vol. 7, n. 4, p. 301–324
QSARSHAPHepatotoxicidadeXGBoost
Revisão SistemáticaMachine Learning2023
Modelos de Linguagem Molecular: Do SMILES ao Espaço Químico Latente
Okonkwo, F.; Santos, G.
Chem & Computing vol. 7, n. 3, p. 210–258
LLMSMILESGeração MolecularTransformer
Artigo OriginalQuímica Quântica2023
Efeitos de Solvente Implícito em Cálculos de Energia de Ionização por CCSD(T)/CBS
Santos, G.; Müller, D.
Chem & Computing vol. 7, n. 2, p. 134–156
CCSD(T)PCMSMDSolvente Implícito
Artigo OriginalDrug Design2022
Triagem Virtual de Alta Eficiência contra a Protease Principal do SARS-CoV-2 com Docking em GPU
Cavalcante, R.; Rodrigues, C.; Watanabe, K.
Chem & Computing vol. 6, n. 1, p. 1–29
SARS-CoV-2Triagem VirtualGlideGPU
ComunicaçãoDFT2022
Benchmark de Funcionais DFT para Energias de Dissociação de Ligações C–H em Sistemas Aromáticos
Santos, G.; Cavalcante, R.
Chem & Computing vol. 6, n. 2, p. 88–101
DFTBDEBenchmarkAromáticos
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